Les domaines d’intervention du FCPEEP constituent ses différents départements ou programmes énumérés ci-dessous :
- Département sécurité
alimentaire et Moyens d’Existence
- Département Santé-Nutrition
- Département environnement et Biodiversité
- Département Education formelle et informelle
- Département Genre ;
Jeunesse, Sensibilité aux Conflits et Gouvernance
- Département Wash and infrastructure
- Département urgence/ RRMP
- Département
suivi-Evaluation et conduite des analyses/Etudes
- Département Communication et ITC