Les domaines d’intervention du FCPEEP constituent ses differents départements ou programes enumérés ci-dessous:
- Département sécurité alimentaire et Moyens d’Existence
- Département Santé-Nutrition
- Département environnement et Biodiversité
- Département Education formelle et informelle
- Département Genre ; Jeunesse, Sensibilité aux Conflits et Gouvernance
- Département Wash and infrastructure
- Département urgence/ RRMP
- Département suivi-Evaluation et conduite des analyses/Etudes
- Département Communication et ITC